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Structs
- archive_io::ArchiveStats
- bin_merge_io::BinMergeTask
- bin_merge_io::MultiSingleCellsResult
- bin_merge_io::PerFileMergeResult
- data_io::CellGeneSparseWriter
- data_io::CellOnFileQuality
- data_io::CellPayload
- data_io::CellQuality
- data_io::CscGeneChunk
- data_io::CsrBatch
- data_io::CsrCellChunk
- data_io::MinCellQuality
- data_io::ParallelSparseReader
- data_io::RawCountsIter
- data_io::SparseDataHeader
- h5_10x_adt_io::TenxDenseModality
- h5_10x_multifile_io::MultiTenxResult
- h5_10x_multifile_io::TenxFileQcResult
- h5_10x_multifile_io::TenxFileTask
- h5_chunked::H5ChunkedReader
- h5ad_multifile_io::H5FileQcResult
- h5ad_multifile_io::H5adFileTask
- h5ad_multifile_io::MultiH5adResult
- in_memory_io::InMemorySparseReader
- mtx_io::MtxFinalData
- mtx_io::MtxHeader
- mtx_io::MtxReader
- mtx_multifile_io::MtxFileQcResult
- mtx_multifile_io::MtxFileTask
- mtx_multifile_io::MultiMtxResult
- obs_var_io::ParquetColumnInfo
- obs_var_io::ParquetFrameInfo
- plotting::GroupedGeneStats
- prelude::CompressedSparseData2
- prelude::LanczosParams
- prelude::RevOrderedFloat
- prelude::SparseAxis
- sc_synthetic_data::CellSweepSyntheticData
- sc_synthetic_data::CellSweepSyntheticParams
- sc_synthetic_data::CellTypeConfig
- sc_synthetic_data::DialogueSyntheticData
- sc_synthetic_data::DialogueSyntheticParams
- sc_traits::F16
- v4_io::ChunkFormat
Enums
- data_io::DataLayerReturn
- data_io::RawCounts
- errors::ScDataErrors
- h5_10x_io::TenxVersion
- h5ad_io::H5ADFormat
- h5ad_io::RawDataSlot
- mtx_io::MtxField
- obs_var_io::FrameKind
- obs_var_io::ParquetColumnType
- prelude::CompressedSparseFormat
- prelude::CoreErrors
- prelude::SparseErrors
- prelude::Verbosity
- sc_synthetic_data::BatchEffectStrength
- sc_synthetic_data::SampleBias
- v4_io::ChunkCodec
Traits
- data_io::SingleCellReading
- h5_chunked::H5Elem
- prelude::BixverseFloat
- prelude::BixverseNumeric
- prelude::BixverseSimd
- prelude::SparseFromDense
- prelude::VecConvert
- prelude::VecFloatConvert
- prelude::VecIndexCast
- sc_traits::FloatAndUInt
Macros
Functions
- archive_io::archive_cell_file
- archive_io::restore_archive
- bin_merge_io::gene_store_to_cell_store
- bin_merge_io::merge_sc_bin_files
- data_io::compress_cell_row
- data_io::dense_gene_map_from_options
- data_io::dense_index_map
- data_io::from_cell_chunks
- data_io::from_gene_chunks
- data_io::keep_set_index_map
- data_io::norm_value
- data_io::peek_file_version
- data_io::peek_target_size
- data_io::write_cell_chunks_built
- data_io::write_cell_chunks_parallel
- data_io::write_cell_rows
- gene_file_io::write_gene_file
- gene_file_io::write_gene_file_v3
- h5_10x_adt_io::read_tenx_h5_modality
- h5_10x_io::detect_tenx_version
- h5_10x_io::get_tenx_dimensions
- h5_10x_io::parse_h5_tenx_quality
- h5_10x_io::parse_tenx_version
- h5_10x_io::read_string_dataset
- h5_10x_io::resolve_tenx_version
- h5_10x_io::stream_h5_tenx_counts
- h5_10x_io::validate_feature_types_tenx
- h5_10x_io::write_h5_tenx_streaming
- h5_10x_multifile_io::multi_10x_h5_to_file
- h5_filters::check_h5_filters
- h5_filters::check_h5ad_filters
- h5_filters::check_tenx_filters
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- h5_filters::unsupported_filters
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- h5ad_io::check_is_raw
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- h5ad_multifile_io::write_h5_dense_row_cells
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- in_memory_io::read_cell_subset_csc
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- obs_var_io::tenx_frame_to_parquet
- obs_var_io::to_snake_case
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- plotting::extract_norm_counts
- plotting::extract_norm_counts_multi
- plotting::extract_raw_counts
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- prelude::array_min
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- prelude::upper_triangle_to_sym_faer
- prelude::zscore_normalise
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- sc_synthetic_data::create_cellsweep_synthetic_data
- sc_synthetic_data::create_celltype_sparse_csr_data
- sc_synthetic_data::create_dialogue_synthetic_data
- sc_synthetic_data::generate_sample_labels
- sc_synthetic_data::parse_batch_effect_strength
- sc_synthetic_data::parse_sample_bias
- v4_io::convert_cell_file_to_v4
- v4_io::convert_gene_file_to_v4
- v4_io::convert_store_v3_to_v4
- v4_io::upgrade_store_to_v4