1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
R`���D�DUCK@ v1.4.4 68d7555 w ���?� ��C��h ���������������� 68d7555 H��ő-k���������d c d d f maini ����c d d e dstf maini � edges� d d targete d ��g h ��d from_nodee d
��g h ��d to_nodee d
��g h ��d supporting_readse d ��g h ������e d ��������e ��f g ��c d d e dstf maini � graphs� d d targete d ��g h ��d start_positione d
��g h ��d end_positione d
��g h ������e d ��������e ���f g ��c d d e dstf maini � nodes� d d targete d ��g h ��d
node_indexe d
��g h ��d node_typee d ��g h ��d reference_allelee d ��g h ��d alternative_allelee d ��g h ��d vafe d ��g h ��d probse d ��g h ��d pose d
��g h ��d indexe d
��g h ������e d ��������e ���f g ���� d d d e f g � ��������� � � � ����e f d e �HYLL ������d d e f g � d e ������� d e ����x������e f d e �HYLL ������d d e f g � d e ������� d e ����x������e f d e �HYLL ������d d e f g � ��������� � � � ����e f d e �HYLL ������e d e ��e � ����� d d d e f g � ��������� � � � ����e f d e �HYLL ������d d e f g � d e ������� d e ����x������e f d e �HYLL ������d d e f g � d e ������� d e ����x������e f d e �HYLL ������e d e ��e � ����� d e f d ��g h d e f g � 14 � 14 � � � ������e d e f d ��g h d e f g ����������d e f d e (��g h d e f g � d e �:��� d e �:��������e d e f d ��g h d e f g ����������d e f d e @��g h d e f g � Referenc� Variant � � � ������e d e f d ��g h d e f g ����������d e f d e x��g h d e f g � A � T � � � ������e d e f d ��g h d e f g ����������d e f d e ���g h d e f g � A � T � � � ������e d e f d ��g h d e f g ����������d e f d e ���g h d e f g � {
norm� {
tumo� � � %������e d e f d ��g h d e f g ����������d e f d e ���g h d e f g � {
PROB� {
PROB� � � �������e d e f d ��g h d e f g ����������d e f d e ���g h d e f g � d e ���0��� d e ���0��������e d e f d ��g h d e f g ����������d e f d e ���g h d e f g � d e ���� d e ���������e d e f d ��g h d e f g ����������d d d e f g � 14 � 14 � � � ����e d e f d e �HYLL ������d d e f g � d e �:��� d e �:������e d e f d e �HYLL ������d d e f g � Referenc� Variant � � � ����e d e f d e �HYLL ������d d e f g � A
� T � � � ����e d e f d e �HYLL ������d d e f g � A � T � � � ����e d e f d e �HYLL ������d d e f g � {
norm� {
tumo� � � %����e d e f d e �HYLL ������d d e f g � {
PROB� {
PROB� � � �����e d e f d e �HYLL
������d d e f g � d e ���0��� d e ���0������e d e f d e �HYLL
������d d e f g � d e ���� d e �������e d e f d e �HYLL �������� ������e d e ��e � ����� d e f d ��������e �
��d ��������e ���d ��������e ���d ��������e ���d ��������e ���d ��������e ���d ��������e ���d ��������e ���d ��������e ���g �� �������� ������� ��mcK��� "