omgkit-depict 0.0.7

2D coordinates and structure drawing for omgkit: SVG with no dependencies, PNG/JPEG behind a feature
Documentation 
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130

// @generated by harness/gen_palette.py — 请勿手工编辑,改了会被下次生成覆盖。
//
// 数据来自 Jmol 的 CPK 配色表,经两份互相独立的转录逐项核对后入库;
// 出处、核对方式、以及 110-118 为什么是 deeppink,全写在
// harness/params/jmol_colors.tsv 的头注释里。
//
// 重新生成:python3 harness/gen_palette.py

/// 按原子序数索引的 CPK 颜色,RGB 各一字节。索引 0 是 SMILES 通配原子 `*`。
pub(crate) static CPK: [[u8; 3]; 119] = [
    [0xff, 0x14, 0x93], // *(通配原子) —— Jmol 表里没有,取未知元素色
    [0xff, 0xff, 0xff], // H
    [0xd9, 0xff, 0xff], // He
    [0xcc, 0x80, 0xff], // Li
    [0xc2, 0xff, 0x00], // Be
    [0xff, 0xb5, 0xb5], // B
    [0x90, 0x90, 0x90], // C
    [0x30, 0x50, 0xf8], // N
    [0xff, 0x0d, 0x0d], // O
    [0x90, 0xe0, 0x50], // F
    [0xb3, 0xe3, 0xf5], // Ne
    [0xab, 0x5c, 0xf2], // Na
    [0x8a, 0xff, 0x00], // Mg
    [0xbf, 0xa6, 0xa6], // Al
    [0xf0, 0xc8, 0xa0], // Si
    [0xff, 0x80, 0x00], // P
    [0xff, 0xff, 0x30], // S
    [0x1f, 0xf0, 0x1f], // Cl
    [0x80, 0xd1, 0xe3], // Ar
    [0x8f, 0x40, 0xd4], // K
    [0x3d, 0xff, 0x00], // Ca
    [0xe6, 0xe6, 0xe6], // Sc
    [0xbf, 0xc2, 0xc7], // Ti
    [0xa6, 0xa6, 0xab], // V
    [0x8a, 0x99, 0xc7], // Cr
    [0x9c, 0x7a, 0xc7], // Mn
    [0xe0, 0x66, 0x33], // Fe
    [0xf0, 0x90, 0xa0], // Co
    [0x50, 0xd0, 0x50], // Ni
    [0xc8, 0x80, 0x33], // Cu
    [0x7d, 0x80, 0xb0], // Zn
    [0xc2, 0x8f, 0x8f], // Ga
    [0x66, 0x8f, 0x8f], // Ge
    [0xbd, 0x80, 0xe3], // As
    [0xff, 0xa1, 0x00], // Se
    [0xa6, 0x29, 0x29], // Br
    [0x5c, 0xb8, 0xd1], // Kr
    [0x70, 0x2e, 0xb0], // Rb
    [0x00, 0xff, 0x00], // Sr
    [0x94, 0xff, 0xff], // Y
    [0x94, 0xe0, 0xe0], // Zr
    [0x73, 0xc2, 0xc9], // Nb
    [0x54, 0xb5, 0xb5], // Mo
    [0x3b, 0x9e, 0x9e], // Tc
    [0x24, 0x8f, 0x8f], // Ru
    [0x0a, 0x7d, 0x8c], // Rh
    [0x00, 0x69, 0x85], // Pd
    [0xc0, 0xc0, 0xc0], // Ag
    [0xff, 0xd9, 0x8f], // Cd
    [0xa6, 0x75, 0x73], // In
    [0x66, 0x80, 0x80], // Sn
    [0x9e, 0x63, 0xb5], // Sb
    [0xd4, 0x7a, 0x00], // Te
    [0x94, 0x00, 0x94], // I
    [0x42, 0x9e, 0xb0], // Xe
    [0x57, 0x17, 0x8f], // Cs
    [0x00, 0xc9, 0x00], // Ba
    [0x70, 0xd4, 0xff], // La
    [0xff, 0xff, 0xc7], // Ce
    [0xd9, 0xff, 0xc7], // Pr
    [0xc7, 0xff, 0xc7], // Nd
    [0xa3, 0xff, 0xc7], // Pm
    [0x8f, 0xff, 0xc7], // Sm
    [0x61, 0xff, 0xc7], // Eu
    [0x45, 0xff, 0xc7], // Gd
    [0x30, 0xff, 0xc7], // Tb
    [0x1f, 0xff, 0xc7], // Dy
    [0x00, 0xff, 0x9c], // Ho
    [0x00, 0xe6, 0x75], // Er
    [0x00, 0xd4, 0x52], // Tm
    [0x00, 0xbf, 0x38], // Yb
    [0x00, 0xab, 0x24], // Lu
    [0x4d, 0xc2, 0xff], // Hf
    [0x4d, 0xa6, 0xff], // Ta
    [0x21, 0x94, 0xd6], // W
    [0x26, 0x7d, 0xab], // Re
    [0x26, 0x66, 0x96], // Os
    [0x17, 0x54, 0x87], // Ir
    [0xd0, 0xd0, 0xe0], // Pt
    [0xff, 0xd1, 0x23], // Au
    [0xb8, 0xb8, 0xd0], // Hg
    [0xa6, 0x54, 0x4d], // Tl
    [0x57, 0x59, 0x61], // Pb
    [0x9e, 0x4f, 0xb5], // Bi
    [0xab, 0x5c, 0x00], // Po
    [0x75, 0x4f, 0x45], // At
    [0x42, 0x82, 0x96], // Rn
    [0x42, 0x00, 0x66], // Fr
    [0x00, 0x7d, 0x00], // Ra
    [0x70, 0xab, 0xfa], // Ac
    [0x00, 0xba, 0xff], // Th
    [0x00, 0xa1, 0xff], // Pa
    [0x00, 0x8f, 0xff], // U
    [0x00, 0x80, 0xff], // Np
    [0x00, 0x6b, 0xff], // Pu
    [0x54, 0x5c, 0xf2], // Am
    [0x78, 0x5c, 0xe3], // Cm
    [0x8a, 0x4f, 0xe3], // Bk
    [0xa1, 0x36, 0xd4], // Cf
    [0xb3, 0x1f, 0xd4], // Es
    [0xb3, 0x1f, 0xba], // Fm
    [0xb3, 0x0d, 0xa6], // Md
    [0xbd, 0x0d, 0x87], // No
    [0xc7, 0x00, 0x66], // Lr
    [0xcc, 0x00, 0x59], // Rf
    [0xd1, 0x00, 0x4f], // Db
    [0xd9, 0x00, 0x45], // Sg
    [0xe0, 0x00, 0x38], // Bh
    [0xe6, 0x00, 0x2e], // Hs
    [0xeb, 0x00, 0x26], // Mt
    [0xff, 0x14, 0x93], // Z=110 —— Jmol 表里没有,取未知元素色
    [0xff, 0x14, 0x93], // Z=111 —— Jmol 表里没有,取未知元素色
    [0xff, 0x14, 0x93], // Z=112 —— Jmol 表里没有,取未知元素色
    [0xff, 0x14, 0x93], // Z=113 —— Jmol 表里没有,取未知元素色
    [0xff, 0x14, 0x93], // Z=114 —— Jmol 表里没有,取未知元素色
    [0xff, 0x14, 0x93], // Z=115 —— Jmol 表里没有,取未知元素色
    [0xff, 0x14, 0x93], // Z=116 —— Jmol 表里没有,取未知元素色
    [0xff, 0x14, 0x93], // Z=117 —— Jmol 表里没有,取未知元素色
    [0xff, 0x14, 0x93], // Z=118 —— Jmol 表里没有,取未知元素色
];