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Module sample

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sample命令 - 对序列进行随机采样

使用蓄水池采样算法从输入文件中随机选择指定数量或比例的序列。

§示例

# 采样1000条序列
seqtkrs sample input.fq 1000 > output.fq

# 采样30%的序列
seqtkrs sample input.fq 0.3 > output.fq

# 使用指定随机种子
seqtkrs sample -s 42 input.fq 1000 > output.fq

# 两遍模式(节省内存)
seqtkrs sample -2 input.fq 1000 > output.fq

Structs§

SampleArgs

Functions§

run