Crate seqtkrs 

seqtkrs - seqtk的Rust实现

这是一个快速、轻量级的生物序列（FASTA/FASTQ）处理工具集， 旨在保持与原版seqtk的算法兼容性，同时利用Rust的内存安全和性能优势。

模块结构

• core: 核心模块（I/O、数据结构、查找表）
• utils: 工具模块（随机数、区域解析、质量值处理）
• algorithms: 算法模块（Mott修剪、采样、X-dropoff）
• commands: 命令实现模块（24个子命令）

快速开始

use seqtkrs::core::{SeqReader, SeqWriter};

// 读取并输出序列
let mut reader = SeqReader::from_stdin();
let mut writer = SeqWriter::to_stdout();

let mut record = seqtkrs::core::SeqRecord::new(Vec::new(), Vec::new());
while reader.read_next(&mut record).unwrap() {
    writer.write_record(&record).unwrap();
}
writer.flush().unwrap();

Modules

algorithms

算法模块

commands

命令实现模块

core

核心模块：提供序列处理的基础设施

utils