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Structs

• classifier::ArgPosition
• classifier::FlankingDatabase
• classifier::FlankingRecord
• classifier::GenusClassifier
• classifier::GenusResult
• extender::ContigExtender
• extender::ExtendedContig
• extender::ExtenderConfig
• fdb::FlankingRecord
• flanking_db::AssemblyInfo
• flanking_db::BuildState
• flanking_db::CatalogEntry
• flanking_db::FlankBuildConfig
• flanking_db::FlankingDbBuilder
• flanking_db::GenomeCatalog
• flanking_db::PlasmidInfo
• flanking_db::PlsdbOptions
• flanking_db::TaxonomyDB
• paf::PafReader
• paf::PafRecord
• seqio::FastaReader
• seqio::FastaRecord
• seqio::FastqReader
• seqio::FastqRecord
• snp::SnpInfo

Enums

• flanking_db::GenomeSizeCategory
• seqio::FastqFile
• snp::SnpStatus

Functions

• arg_db::build
• arg_db::build_flanking_db
• arg_db::build_from_unified
• extender::write_extended_contigs
• fdb::build
• flanking_db::build
• snp::is_snp_gene
• snp::parse_snp_info
• snp::translate_codon
• snp::verify_snp