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Structs
- Aligner
- IDX2NT
- SEQ_NT4_TABLE
- abpoa::AbPoaResT
- abpoa::AbpoaParam
- abpoa_result_parser::MsaResult
- abpoa_sys::_IO_FILE
- abpoa_sys::_IO_codecvt
- abpoa_sys::_IO_marker
- abpoa_sys::_IO_wide_data
- abpoa_sys::__BindgenBitfieldUnit
- abpoa_sys::abpoa_cons_t
- abpoa_sys::abpoa_graph_t
- abpoa_sys::abpoa_node_t
- abpoa_sys::abpoa_para_t
- abpoa_sys::abpoa_res_t
- abpoa_sys::abpoa_seq_t
- abpoa_sys::abpoa_simd_matrix_t
- abpoa_sys::abpoa_str_t
- abpoa_sys::abpoa_t
- wrapper::AbpoaParam
Enums
Functions
- abpoa::abpoa_consensus_dna
- abpoa::abpoa_consensus_dna_core
- abpoa::free
- abpoa::msa
- abpoa::msa_with_adaptive_fwd_rev
- abpoa::parse_consensus_seq_from_abpoa_cons_t_dna
- abpoa_result_parser::abpoa_result_parser
- abpoa_sys::abpoa_BFS_set_node_index
- abpoa_sys::abpoa_BFS_set_node_remain
- abpoa_sys::abpoa_add_graph_alignment
- abpoa_sys::abpoa_add_graph_edge
- abpoa_sys::abpoa_add_graph_node
- abpoa_sys::abpoa_add_subgraph_alignment
- abpoa_sys::abpoa_align_sequence_to_graph
- abpoa_sys::abpoa_align_sequence_to_subgraph
- abpoa_sys::abpoa_dump_pog
- abpoa_sys::abpoa_free
- abpoa_sys::abpoa_free_para
- abpoa_sys::abpoa_generate_consensus
- abpoa_sys::abpoa_generate_gfa
- abpoa_sys::abpoa_generate_rc_msa
- abpoa_sys::abpoa_init
- abpoa_sys::abpoa_init_para
- abpoa_sys::abpoa_msa
- abpoa_sys::abpoa_msa1
- abpoa_sys::abpoa_output
- abpoa_sys::abpoa_output_fx_consensus
- abpoa_sys::abpoa_output_rc_msa
- abpoa_sys::abpoa_post_set_para
- abpoa_sys::abpoa_reset
- abpoa_sys::abpoa_restore_graph
- abpoa_sys::abpoa_set_mat_from_file
- abpoa_sys::abpoa_subgraph_nodes
- abpoa_sys::abpoa_topological_sort
- utils::reverse_complement