[−] List of all items
Structs
Functions
- durbin_algo::durbin_algo
- durbin_algo::get_cap_mat
- durbin_algo::get_cap_mat_and_unaligned_char_psp
- durbin_algo::get_log_cap_mat
- durbin_algo::get_log_sa_ppf_mats
- utils::logsumexp
Typedefs
- utils::CaScoreMat
- utils::Char
- utils::CharPair
- utils::EpsOfTerms4LogPf
- utils::EpsOfTerms4LogProb
- utils::ExpPartOfTerm4LogPf
- utils::ExpPartOfTerm4LogProb
- utils::Hasher
- utils::LogPartialPfs
- utils::LogPf
- utils::LogPpfMat
- utils::LogProb
- utils::LogProbMat
- utils::LogProbs
- utils::PartitionFunc
- utils::Pos
- utils::PosPair
- utils::Prob
- utils::ProbMat
- utils::ProbSeqPair
- utils::Probs
- utils::SaScore
- utils::Seq
- utils::SeqSlice
- utils::SliceOfEpsOfTerms4LogPf
- utils::SliceOfEpsOfTerms4LogProb
- utils::SsPair